D3 Publisher fue fundada en el año 1992 en Tokyo, Japón. Desde su fundación ha creado juegos para muchas plataformas, empezando por GBA hasta las actuales.
En 2007 D3 Publisher adquirió el estudio Vicious Cycle Software. En 2009 Namco Bandai Holdings compró el 95% de la compañía.
